伊恩结

受『比特新声』安利,平日里会时不时地看一下『利器』,这是『离线』杂志搞的一个网站,一开始是采访优秀的创造者,邀请他们来分享工作时所使用的工具,以及使用工具的方式和原则;然后慢慢丰富到有周报,群分享等内容,可以说是越来越丰富。 今天就给大家安利一发这个『伊恩结』!伊恩结是在『利器』的某一期周报看到的。众所周知,我们现在系鞋带用的最多的应该是蝴蝶结。蝴蝶结其实不算方便,而且容易松开;而这个伊恩结却有着蝴蝶结相似的系法(所以有着相似的外观),而且说不会松开不会比蝴蝶结不容易掉。 »

ANNOVAR 注释软件

ANNOVAR简介 ANNOVAR是由王凯编写的一个注释软件,可以对SNP和indel进行注释,也可以进行变异的过滤筛选。 ANNOVAR能够利用最新的数据来分析各种基因组中的遗传变异。主要包含三种不同的注释方法,Gene-based Annotation(基于基因的注释)、Region-based Annotation(基于区域的注释)、Filter-based Annotation(基于筛选的注释)。 ANNOVAR由Perl编写。 优点:提供多个数据可直接下载、支持多种格式、注释直观; 缺点:没有数据库的物种无法注释。 ANNOVAR结构 ANNOVAR │ annotate_variation. »

Pileup Format 学习笔记

Pileup format is first used by Tony Cox and Zemin Ning at the Sanger Institute. It desribes the base-pair information at each chromosomal position. This format »

SAM 文件学习笔记

The SAM Format Specification SAM stands for Sequence Alignment/Map format. It is a TAB-delimited text format consisting of a header section, which is optional, and »