郑泽鑫的博客

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使用 Github Actions 自动更新 ANNOVAR 的 Clinvar 数据库

前段时间，看到ANNOVAR在文档里更新了一个可以自行更新Clinvar数据库的脚本，ANNOVAR更新Clinvar的频率，一般是半年到一年才更新一次。恰好又看到Github新推出了“Flat Data”，就想着是不是能够像Flat Data一样，抓取Clinvar数据库，然后定期更新成ANNOVAR数据库。

Posted June 14. 2021. 2165 words. 10 min read. views.

# Github # 生物信息

2020 年终总结

今年年初时小山狗的那篇文章在群里转发开来，一方面，我惊讶于他们的速度（24日收到样品，27日口头报告新冠病毒，而到了30日，已经有3家公司报告了这个病毒）；另一方面。。。

Posted December 31. 2020. 2176 words. 10 min read. views.

# 年终总结 # 生活

解包一个 PAR 打包的 perl 程序源码

最近在流程debug时，和同事发现一个perl脚本有问题；然后发现这个perl脚本是别人打包好的，所以看不到源码。我就想把这个perl脚本给解包（不敢称为反编译，因为实际上也没做反编译）了。

Posted October 18. 2020. 680 words. 3 min read. views.

# 生物信息 # Perl

阿里云PBS作业排队管理

找了很久PBS的文档，阿里云的PBS应该是OpenPBS，现在名字叫做[PBS Pro](https://www.pbspro.org/)，找了很久才找到个18.2版本的说明书，虽然服务器上的是18.1，但是版本相差不大，应该也通用。

Posted June 27. 2020. 795 words. 4 min read. views.

# 阿里云 # 生物信息 # PBS

VPS装机记录（3）：任务机器人

VPS基本设置好后，开始想在上面放一些自动化的东西，那么我们就需要一个机器人，设想的目的是，我们在常用的社交软件发送一条命令或者设置好的指令，机器人就会在VPS上自动执行，并返回结果。

Posted June 27. 2020. 1153 words. 6 min read. views.

# shell-bot # VPS # 机器人 # 代码

VPS装机记录（2）：使用mosh

家里的网络有点差，之前买的VPS，直接连接SSH，输命令时有时卡卡的，于是就想到之前看到过的[`mosh`](https://mosh.org/)。引用维基百科的话来介绍一下`mosh`的特性。

Posted April 16. 2020. 895 words. 4 min read. views.

# mosh # VPS # 代码

2019 年终总结

>“听到一个段子：2019 年可能会是过去十年里最差的一年，但却是未来十年里最好的一年。”

Posted December 31. 2019. 1260 words. 6 min read. views.

# 年终总结 # 生活

VPS装机记录（1）：SSH篇

前段时间趁黑五折扣，买了个[小鸡](https://zhuanlan.zhihu.com/p/23151978)[^1台独立服务器开出来的多台虚拟机，叫作小鸡]来玩，由于是什么都没有的centos系统，因此一切装机都要靠自己来，也顺便记录一下自己的心得。

Posted December 14. 2019. 2703 words. 12 min read. views.

# 装机 # 2步验证 # SSH # VPS # 密钥 # Google Authenticator # 代码 # fail2ban